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1、交易时限的区别
(1)一类经济适用房：
是两限房房本，必须满五年以后才可以交易，交易需补交10%的综合地下款。
交付使用不足5年的，该房产只能按照原购买价格出售给符合经济适用房购买资格的家庭，交易一次以后房本性质变更为商品房。
(2)二类经济适用房：
这类房产大多数是“拆迁安置”类房产或者“回迁房”，他们只是产土地出让金，交纳该土地出让金后，其产权性质变为商品房。
2、缴税计算的不同
(1)一类经济适用房税费速算表一套90平米经济适用房，业主于2010年以200万购买，业主家庭名下唯一住房，现在以300万网签价出售，以网签价计税，买方是二套购房产，房产税算式如下
A.增值税，满两年，免征。
B.契税，二套房，税率为3%。契税=(网签价-增值税)×3%=9万元
C.个人所得税，满五唯一，免征。
D.综合地价款(300-200)×70%=70万元
总税费：70+9=79万元
(2)二类经济适用房税费速算表一套86平回迁房，原业主于2013年以200万价格购买，现在转手卖出，网签价300万，核定价为289万，业主名下没有其他住房，买家名下没有房产，首套购房，无贷款，房产税算式如下
A.契税：300×1%=3万元(首套房，面积90平米以下)
B.增值税：0元(房子满2年)
C.个人所得税：(300-200-200×1%-300×10%)×20%=13.6万元
D.土地出让金：300×3%=9万元总税费：13.6+3+9=25.6万元
区分一类和二类的方法
一类:
买这类房是要有指标的本地户口，家庭年收入不高于8万，然后还要进行公示一星期，取得经济房住房标准才可以。房本上也写着以经济价购买或经济适用房。
二类：
房本上写的是以经济适用房管理等字样，区别是一类五年才能上市，二类直接可以上市。
